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This compound is a nucleoside phosphoramidite used as a building block in the chemical synthesis of oligonucleotides. It incorporates a protected acetylcytosine base, a propargyl ether group on the ribose, and a dimethoxytrityl (DMT) protecting group, along with a cyanoethyl phosphoramidite moiety for automated solid-phase DNA/RNA synthesis.
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N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-prop-2-ynoxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
JIMYWWYYWAHJAD-ZMHKPELYSA-N
CC(C)N(C(C)C)P(OCCC#N)O[C@@H]1[C@H](O[C@H]([C@@H]1OCC#C)N2C=CC(=NC2=O)NC(=O)C)COC(C3=CC=CC=C3)(C4=CC=C(C=C4)OC)C5=CC=C(C=C5)OC